Malgré sa proximité du centre de Tôkyô, le mont Takao garde toujours les forêts naturelles vastes, en plus des forêts artificielles de cèdres du Japon (Cryptomeria japonica) et de cyprès du Japon (Chamaecyparis obtusa) qui sont communes dans ses environs. Les forêts d'arbres à larges feuilles persistantes tels que les chênes s'étendent sur le versant sud et les forêts d'arbres à larges feuilles caduques tels que les hêtres sur le versant nord. En profitant de cette flore diversifiée pour se nourrir et s'abriter, quelques dizaines d'espèces d'animaux vivent, comme les écureuils volants (Petaurista leucogenys) et les écureuils du Japon (Sciurus lis) dont l'existence est bien connue. Une randonnée en recherche de ces animaux est une façon de goûter le charme du mont Takao.