高尾山林相豐富，分布有暖溫帶和冷溫帶氣候的各種植物。在這裡自然生長的植物種類甚多，一年四季呈現出不同的繽紛風貌，種類總計超過1600種，足以媲美英國全國自然生長的植物種類。更有許多植物是在高尾山最早發現的，如高尾菫菜、高尾平江帶等，多達60餘種。